Como función específica: Proyectos de Políticas y Estrategias Ambientales; incluye el análisis de los principales problemas ambientales de acuerdo a la Ley 81 de Medio Ambiente y otras regulaciones ambientales vigentes en el país. Proyectos de Diagnóstico Ambiental y Sistemas de Gestión Ambiental; incluye la evaluación del desempeño ambiental en el sector empresarial. Proyectos de Evaluación de Impacto Ambiental (EIA); identificar, evaluar, predecir y prevenir cualquier alteración estructural o funcional en los componentes naturales y/o socio-económicos del ambiente considerado generado por un proyecto o actividad (industria, turismo, viales, minería, soluciones ambientales, drenajes y alcantarillados) Proyectos de Solicitud de Licencias Ambientales; incluye la descripción del proyecto, la caracterización del medio natural y socioeconómico, consumo de agua y energía, generación de desechos, identificación y análisis de impactos ambientales, medidas de mitigación, planes de riesgo y contingencias. Proyectos de Planes de Contingencia contra Derrames de Hidrocarburos; incluye la elaboración de un Plan de Contingencia con la participación de todas las entidades portuarias involucradas y los costos asociados.

Ofrece un servicio especializado en el estudio de la calidad ambiental de los ecosistemas marinos y costeros, para lo que dispone de especialistas experimentados que utilizan metodologías analíticas normalizadas a fin de satisfacer las exigencias y regulaciones normativas de los estudios ambientales o de otros servicios específicos que se requieran. La división cuenta con un laboratorio de ensayos adscrito, donde se realizan ensayos químicos, físicos, ecotoxicológicos y microbiológicos en aguas, sedimentos y biota marina, el cual funciona bajo un Sistema de Gestión de la Calidad según la Norma Cubana NC-ISO/IEC 17025:2006.

Se dispone de un Sistema de Gestión de la Calidad Certificado (Registro No. 018-2008, ONN), por la norma cubana NC-ISO 9001:2008 para el alcance Investigaciones Ingenieras Topobatimétricas y Estudios Técnicos Estructurales de obras hidrotécnicas; lo cual le permite establecer un estricto control de la calidad de los resultados alcanzados acorde a normas nacionales e internacionales. El personal de la División de Ordenamiento Litoral está homologado por el Registro Cubano de Buques (RCB Sociedad Clasificadora), para realizar los estudios previstos en la Certificación de las instalaciones hidrotécnicas; acorde a lo establecido en la Resolución 216-09 del MITRANS. Está inscrito y acreditado en el Registro Nacional de Constructores, Proyectistas y Consultores de la República de Cuba, para prestar servicios como Contratista, Proyectista y Consultor en proyectos de Asistencia, Asesoría y Defectación Técnica; Estudios Técnicos-Económicos y Servicios Integrados de Ingeniería (Licencias No. 099/01 y 206/01). Cuenta con Servicio de Investigaciones Ingenieras Topobatimétricas. Es un servicio certificado (Registro No. 018-2008, ONN), que consistente en la realización de levantamientos topobatimétricos en cajas de atraque, dársenas de maniobras y canales de acceso a diferentes escalas, etc. Servicio de Inspecciones Técnicas Estructurales. Es un servicio certificado (Registro No. 018-2008, ONN), que consiste en inspeccionar, evaluar, diagnosticar y reportar el estado técnico de la superestructura y subestructura de obras y/o instalaciones hidrotécnicas. Inspecciones subacuáticas. Consiste en inspeccionar y reportar el estado de obras y/o instalaciones hidrotécnicas sumergidas (muelles, espigones, piñas de atraque, medios de varada, emisarios submarinos, etc.). Participa y apoya otras investigaciones medio ambientales de la Entidad con la colecta de muestras de aguas y sedimentos Ingeniería de Puertos y Costas. Se realizan estudios y proyectos para la solución de distintos aspectos de interés socioeconómicos, vinculados a las actividades de Medio Ambiente, Transporte, Turismo, I + D, etc. Consultorías ambientales. Con vistas a identificar, evaluar, caracterizar, prevenir y predecir cualquier alteración funcional del medio físico, de la dinámica del sistema, en ecosistemas marinos y/o litorales, generada por una actividad natural o antrópica (industrias, turismo, viales, minería, soluciones ambientales, drenajes y alcantarillados) e incluye los monitoreos, estudios de línea base ambiental [LBA] y evaluaciones de impacto ambiental [EsIA].