Ofrece un servicio especializado en el estudio de la calidad ambiental de los ecosistemas marinos y costeros, para lo que dispone de especialistas experimentados que utilizan metodologías analíticas normalizadas a fin de satisfacer las exigencias y regulaciones normativas de los estudios ambientales o de otros servicios específicos que se requieran. La división cuenta con un laboratorio de ensayos adscrito, donde se realizan ensayos químicos, físicos, ecotoxicológicos y microbiológicos en aguas, sedimentos y biota marina, el cual funciona bajo un Sistema de Gestión de la Calidad según la Norma Cubana NC-ISO/IEC 17025:2006.